吕军生于1967年，毕业于中国农业大学，农业系统工程及管理工程专业，工程学硕士。1993年加入中粮集团，曾任集团党组成员、副总裁。2013年加入中储粮总公司，曾任党组书记、董事长。2018年，任中粮集团党组书记、董事长。
当天18时33分，国资小新发布消息：2018年7月9日下午，中粮集团有限公司召开中层以上管理人员大会。中央组织部高选民副部长宣布了中央关于中粮集团有限公司主要领导调整的决定：吕军同志任中粮集团有限公司董事长、党组书记，免去其中国储备粮管理集团有限公司董事长、党组书记职务；免去赵双连同志的中粮集团有限公司董事长、党组书记职务，退休。有关职务任免按有关法律和章程办理。
赵吕二人在中储粮供职时曾有过一段共事历史。2012年4月，赵双连出任中储粮总经理，此前任内蒙古自治区副主席、党组成员。2010年至2013年，被称为“国家粮仓”的中储粮因旗下河南公司腐败窝案、黑龙江粮库大火等事件频频卷入舆论漩涡。2013年5月至8月，中央第一巡视组对中储粮进行巡视。巡视反馈显示，中储粮存在基层腐败案件高发多发、虚报库存、掺杂作假等问题。同年10月，中储粮领导层变更，赵双连接替包克辛出任党组书记、董事长，包克辛卸任。也就是在此次人事变更中，时任中粮集团副总裁的吕军“空降”中储粮，出任总经理一职。2016年1月，赵双连卸任中储粮董事长、党组书记，赴中粮集团履职，4个月后，吕军接任中储粮董事长、党组书记职务。
中粮集团是中国最大的粮油食品进出口公司。除粮、油、糖、棉核心业务外，中粮集团还建立了食品、金融和地产三大主营业务。目前，该集团资产总额5444亿元，年营业收入4709亿元，年经营总量近1.6亿吨，全球仓储能力3100万吨，年加工能力9000万吨，年港口中转能力6500万吨。中粮集团旗下拥有13家上市公司，其中包括中国食品（00506.HK）、中粮控股（00606.HK）、蒙牛乳业（02319.HK）、中粮包装（00906.HK）、大悦城地产（00207.HK）、中粮肉食（01610.HK）、福田实业（00420.HK）、雅士利国际（01230.HK）、现代牧业（01117.HK）九家香港上市公司，以及中粮糖业（600737.SH）、酒鬼酒（000799.SZ）、中粮地产（000031.SZ）、中粮生化（000930.SZ）四家内地公司。
中储粮公司受国务院委托，具体负责中央储备粮（含中央储备油，下同）的经营管理，同时接受国家委托执行粮油购销调存等调控任务，在国家宏观调控和监督管理下，实行自主经营、自负盈亏，以政策性业务为主。2000年以前，中央储备粮分级管理于各级地方企业手中，政企不分，责任不清，导致“储备粮数量不实、质量不保、调动困难、巨额亏损挂账”等问题。2000年，党中央、国务院决定对中央储备粮管理体制进行重大改革，组建中储粮总公司。截至2016年底，集团公司资产总额14913亿元，员工总数4.4万人，全年营业收入2099亿元。
两年前，中粮集团和中储粮公司都曾经历央企重组。2016年7月，国务院国资委发布消息，经报国务院批准，创建于1951年、以纺织和粮油为主业的中国中纺集团公司整体并入中粮集团有限公司，成为后者的全资子企业。中纺集团不再作为国资委直接监管企业。同年11月，国务院国资委宣布中国储备棉管理总公司整体并入中储粮总公司。