脉动真空灭菌器是将饱和水蒸汽当成灭菌介质，应用器械使脉动真空的空气强行排除的方法，历经数次抽真空与数次注入蒸汽的交替价值，使灭菌室符合限定的真空度后，将饱和蒸汽充入，以此符合规定的压力饱和度，更好的对灭菌物实施灭菌，主要包含脉动真空与预真空两个时期。
脉动真空是数次对灭菌室实施抽真空，在完成一次抽真空后，把一定量的蒸汽放入灭菌器，使剩余的空气与蒸汽融合，以此满足一定的蒸汽，再实施抽真空作业，在历经数次的抽真空Z后进入蒸汽灭菌的方式。
预真空指的是，高压蒸汽灭菌对灭菌室进入蒸汽之前，实施一次抽真空，尽Z大限度的除去灭菌室的空气后，再融入蒸汽实施灭菌的方式。
脉动真空灭菌的根本原理是，应用真空泵出现的负压，将灭菌室中的冷空气抽出，再次输入饱和蒸汽实施灭菌工作，抽真空干燥是Z后一道程序。
完整的工程程序是：准备-脉动-升温-灭菌-排蒸汽-干燥、完成。
2、脉动真空灭菌的根本原理
二、影响灭菌效果的因素
1、物理/化学条件
在细菌形成芽孢过程中的多种环境因素会影响孢子的耐热性。例如，温度较高并有二价阳离子(如Ca2+、Fe2+、Mg2+、Mn2+)存在时，芽孢的耐热性增强。与此相反，当pH超出6.0～8.0的范围时，或在高浓度的盐水或磷酸盐中形成芽孢时，其耐热性下降。
由于被灭菌品受到了泥土中芽孢的污染，如在运输处理中被未经过滤空气微粒所致的污染，或者由人员或其他物品接触遭受污染时，要将芽孢完全杀灭会很困难。正因为如此，GMP要求采取一切必要的措施防止污染。
2、相对湿度
实验数据表明，温度在90～125℃之间，相对湿度在20%～50%时，细菌芽孢较难杀灭;当相对湿度高于50%或低于20%时，则较易杀灭。这对选择灭菌条件具有指导意义。
三、结构组成和工作流程
1、结构组成
2、工作流程
一个完整的工作流程包括：准备、脉动、升温、灭菌、排气、干燥、结束等7个过程。管道原理图，见下图。
在蒸汽气源、水源、压缩空气等正常并开启状态下，设备得电后即自动打开进气阀门F1，经过进气口减压阀向灭菌器夹层进气，夹层内压力由压力控制器YK控制，一般在0.22MPa左右，当到达设定压力后，F1关闭，周而复始。此时夹层疏水器开始工作，排除夹层内冷凝水，并对设备内室预热，设备处于准备状态。
消毒物品摆放完毕后将消毒车推入灭菌器，关闭灭菌器密封门。
根据控制面板设定好的程序，首先进入脉动过程，一般设定抽真空3次。F3气动阀打开，F6、F7水阀打开，真空泵运转，通过冷凝器抽取内室空气，直至设定好的负压值(一般为-80kPa)。这时F3、F6、F7、真空泵关闭，F2内室进气阀打开，从夹层向内室充入饱和蒸汽，当到达设定好的压力上限时，F2自动关闭，再一次进行内室抽真空，周而复始，直至完成设定的脉动次数。
接着进入升温阶段，F3、F6、F7、真空泵均关闭，F2打开，向内室进蒸汽，逐渐升高内室温度，当内室压力到达限度值时，F2自动关闭;当内室压力小于等于压力限度值时，F2自动打开。
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