首先，根据蜂场和周围环境卫生状况，结合本地蜜蜂病害发生和防控形势，以及蜂场生产实际，把消毒纳入蜂场日常饲养管理工作之中，规范消毒流程各个环节。要注意饲料和饮水卫生，做到对蜂场内设置的饮水器经常消毒，来历不明的花粉等饲料在使用前应灭菌消毒处理，不使用患病蜂群生产的花粉。保持蜂场及生产场所环境的干净、卫生，及时清除蜂场场地上的蜂尸、脏物，对携带病原菌的蜂尸、巢脾等集中采取土埋、焚烧等无害化处理。
其次，蜂场应配备合适的卫生消毒设备（如消毒喷雾器、火焰消毒器等），备有足量、有效的消毒药物，有条件的蜂场可设立专门的无害化处理装置、消毒间等卫生消毒设施。
二、蜂场消毒的种类
养蜂生产过程中，蜂场环境、蜂机具和蜜蜂饲料等随时可能遭受病原微生物的污染，进而通过蜂体接触或伴随养蜂者饲养管理过程流行传播，消毒是阻断病原体传播、预防蜜蜂疾病发生并有效控制其蔓延的重要手段。养蜂生产所涉及的消毒类型，主要包括预防性消毒、紧急性消毒和终末消毒三种。
在蜂群或周边蜂场未发生传染病时，养蜂者可结合日常饲养管理需要，对易受病原污染的养蜂场地、蜂机具、饮水、饲料、防护服以及蜂产品生产和贮存场所定期进行预防性消毒（又称定期消毒），以预防蜜蜂病虫害的发生。
在蜜蜂病虫害发生和流行期间，养蜂者应及时对患病蜂群采取隔离措施，并对养蜂场地（尤其是患病蜂群周围场所）、隔离场地，以及可能遭受污染的一切场所、蜂机具和养蜂者的防护服等物品进行多次、彻底的紧急性消毒（又称突击性消毒或随时消毒），可以有效减少和消灭病原体，防止其进一步蔓延。
在蜂场患病蜂群痊愈、病死蜂群无害化处理完毕或所在疫区解除封锁之前，为彻底消灭残留病原体，养蜂者还须对养蜂场地、生产和生活场所、蜂机具等一切物品、用具等进行全面彻底的消毒（即终末消毒），以巩固消毒效果。
三、蜂场消毒的程序与主要方法
1、人员消毒
养蜂人员在管理蜂群，接触饲料之前或接触患病蜜蜂及受病原体污染的蜂机具之后必须洗手，并用医用酒精（75%）、新洁尔灭溶液（0.1%）或来苏尔溶液（1%-2%）浸泡3-5分钟等彻底消毒。规模化养蜂场应配备专用的工作服，养蜂者应养成着工作服管理蜂群的良好习惯，并经常对工作服清洗、消毒。尽量避免外来人员参观蜂场和开箱检查蜂群，必须开箱检查时，必须穿戴工作服并洗手消毒。
2、环境消毒
保持蜂场环境清洁卫生，定期对蜂群周围场地进行清扫，清除爬蜂及病死蜜蜂尸体、杂物。定期（每3-4周）用喷洒氢氧化钠溶液（2%-10%）、来苏尔溶液（5%-10%）或撒生石灰的方式对蜂箱周围环境进行消毒。定期通过用0.1%-0.5%过氧乙酸拖地、喷洒等方式对生产场所、贮存巢脾或蜂机具仓库等场地进行消毒。
3.饮水消毒
养蜂者要特别注意保持喂水器的干净卫生，每天更换新水，并经常对喂水器进行刷洗、消毒，以彻底杀灭饮用水中的病原体。饮水消毒以含氯消毒剂最为常用，养蜂者可选用的消毒剂有漂白粉、氯片、二氧化氯、次氯酸钠等。当消毒液中有效氯浓度为200-300mg/L时，浸泡饮水器约20分钟就可达到显著的杀菌消毒效果。
4.蜂机具消毒
养蜂者应经常对蜂箱、巢脾、蜂刷等蜂机具进行消毒，接触患病蜂群、蜂脾后的蜂机具必须彻底消毒后再次使用。消毒时可根据蜂场实际条件和消毒对象特性灵活选用阳光曝晒、火焰喷烧、煮沸、熏蒸、消毒剂浸泡等消毒方法。使用消毒剂浸泡消毒时，可选用的消毒剂有高锰酸钾溶液（0.1%-0.3%）、来苏尔溶液（3%-5%）、过氧乙酸溶液（0.2%-0.5%）、氢氧化钠溶液（1%-10%）或漂白粉溶液（10%～20%）和新洁尔灭溶液（0.1%-0.2%）等，浸泡30-60分钟后用清水洗净晾干。
5.饲料消毒
当养蜂者使用来历不明或可能遭受病原体污染的蜂蜜、蜂花粉等饲料喂蜂时，必须先对这些饲料进行严格消毒。饲料用蜂蜜或可能受污染的白砂糖等，加水煮沸30-60分钟即可消灭病原体。蒸汽消毒是养蜂者尤其是转地放蜂养蜂者最为简便的蜂花粉消毒方法，将花粉直接放入蒸锅屉布上蒸30-40分钟，即可杀灭一般细菌等病原微生物，需要注意的是普通蒸汽消毒并不能杀灭细菌的芽孢，但使用高压消毒器时，121℃消毒15-30分钟即可彻底杀灭芽孢和病毒。有条件的蜂场，还可委托具有辐照灭菌资质的单位或公司对疑受病原污染的饲料（如蜂花粉、饲料用蜂蜜等）、蜂机具（如患病蜂群巢脾、蜂箱等）等蜂机具进行辐照灭菌、消毒和杀虫处理，辐照剂量为4-10kGy时即实现很好的杀菌、杀虫效果。
6.病死蜜蜂消毒
对于患有急性传染病（如中囊病等）、发病严重或死亡的蜂群、蜜蜂或遭病原体严重污染的巢脾等，要及时进行深埋、焚烧、消毒等无害化处理。同时，对所有可能受到病原体污染的蜂箱等蜂机具、养蜂者自身、工作服和蜂场环境等也要进行彻底消毒。