动物疫病传播有三个环节：传染源、传播途径、易感动物。在动物防疫工作中，只要切断其中一个环节，动物传染病就失去了传播的条件，就可以避免某些传染病在一定范围内发生，甚至可以扑灭疫情、最终消灭传染病。由于多种因素的影响在目前条件下无法彻底消灭传染源，同时受细菌的致病力、病毒毒力、动物的母源抗体、动物本身的营养、饲养环境、健康状况、免疫程序等因素的影响，往往导致疫苗免疫注射的抗体保护率只能达到一定比例，保护率不能达到绝对的100%（一般只能达到70%～80%左右）；因此，对规模养殖场来说，做好隔离工作，切断传播途径，在防止重大动物疫病方面就显得尤为重要。规模养殖场的隔离工作，要重点做好以下几个方面：
1、自然环境隔离。建场选址应离开交通要道、居民点、医院、屠宰场、垃圾处理场等有可能影响动物防疫因素的地方，养殖场到附近公路的出路应该是封闭的500米以上的专用道路；场地周围要建隔离沟、隔离墙和绿化带;场门口建立消毒池和消毒室；场区的生产区和生活区要隔开；在远离生产区的地方建立隔离圈舍；畜禽舍要防鼠、防虫、防兽、防鸟；生产场要有完善的垃圾排泄系统和无害化处理设施等。山区、岛屿等具有自然隔离条件的地方是最理想的场址。
2、要建立独立的隔离区。一般规模养殖场都设有隔离区，用于对本场患病动物和从外界新采购动物的隔离，但往往达不到预期效果。因为这些隔离区都建在生产区的范围内，与养殖场的人员、道路、用具、饲料等方面存在各种割不断的联系，因此形同虚设。建议重新认识隔离区的含义，建立真正意义上的、各方面都独立运作的隔离区，重点对新进场动物、外出归场的人员、购买的各种原料、周转物品、交通工具等进行全面的消毒和隔离。
4、人员隔离。做好人员隔离对防控重大动物疫病具有十分重要的意义。生产人员进入生产区时，应洗手，穿工作服和胶靴，戴工作帽；或淋浴后更换衣鞋。工作服应保持清洁，定期消毒。饲养员严禁相互串栋。在外界（主要指国内）有疫情发生的情况下，严禁生产人员外出;如必须外出的人员外出后，应待疫情全部扑灭后才可进场，或经过严格的隔离和消毒后才能进场。生产人员和非生产人员也要进行隔离。非生产人员原则上不能外出。严禁所有人员接触可能携带病原体的动物及产品加工、贩运等人员。要坚决出售因故出场或与外界接触的动物。
6、建立和遵守完善的隔离制度。要针对防疫工作建立完善的人员管理制度、消毒隔离制度、采购制度、中转物品隔离消毒制度等规章制度并认真实施，切断一切有可能感染外界病原微生物的环节。