畜禽泛基因组研究进展

泛基因组近年来已广泛应用于微生物、植物及动物研究中,在探究物种起源驯化以及改良遗传育种体系等方面展现出巨大潜力。以下总结了泛基因组在畜禽领域中的最新研究成果。

泛基因组学经过多年发展已逐渐成熟,是基因组学研究领域的热点。第三代测序技术的落地极大地推动了泛基因组学的快速发展。利用泛基因组挖掘关键的遗传变异信息,结合重要表型性状和多组学数据等,是研究生物重要性状的有力工具。未来,随着测序技术的进一步发展和算法水平的不断提高,实现结合端粒到端粒的基因组组装(telomere-to-telomere,T2T)和精确检测基因组结构变异信息等,对于泛基因组学的发展和应用具有重要意义。海量测序数据的不断产生为构建泛基因组数据库提供了数据基础。通过整合多个代表性个体的基因组信息,结合多组学数据和群体变异信息为进一步挖掘调控重要性状的基因提供基础,也为功能基因组学的研究提供了便利。目前,泛基因组研究由于计算资源等的制约大多集中在“种”水平,但未来“属”水平的超级泛基因组(super-pangenome)会成为泛基因组研究的新热点和新方向。

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