鸟类养殖证件应该怎么办理，符合条件的向县级以上人民政府畜牧兽医行政主管部门申请办理，养殖场、养殖小区兴办者应当将养殖场、养殖小区的名称、养殖地址、畜禽品种和养殖规模，向养殖场、养殖小区所在地县级人民政府畜牧兽医行政主管部门备案，取得畜禽标识
符合条件的向县级以上人民政府畜牧兽医行政主管部门申请办理，养殖场、养殖小区兴办者应当将养殖场、养殖小区的名称、养殖地址、畜禽品种和养殖规模，向养殖场、养殖小区所在地县级人民政府畜牧兽医行政主管部门备案，取得畜禽标识代码。
法律依据：
《中华人民共和国畜牧法》第三十九条畜禽养殖场、养殖小区应当具备下列条件：
（一）有与其饲养规模相适应的生产场所和配套的生产设施；
（二）有为其服务的畜牧兽医技术人员；
（三）具备法律、行政法规和国务院畜牧兽医行政主管部门规定的防疫条件；
（四）有对畜禽粪便、废水和其他固体废弃物进行综合利用的沼气池等设施或者其他无害化处理设施；
（五）具备法律、行政法规规定的其他条件。
养殖场、养殖小区兴办者应当将养殖场、养殖小区的名称、养殖地址、畜禽品种和养殖规模，向养殖场、养殖小区所在地县级人民政府畜牧兽医行政主管部门备案，取得畜禽标识代码。
省级人民政府根据本行政区域畜牧业发展状况制定畜禽养殖场、养殖小区的规模标准和备案程序。
一、禁养区的养殖场拆迁有补偿吗？
1、对养殖场的建筑物、附属设施等的补偿
我们所讲的建筑物，一般是指养殖场的禽畜圈舍、饲养人员的宿舍、养殖场的办公用房等等。附属设施则是指化粪池、遮凉棚、水井等等。
建筑物的补偿标准是根据评估来确定的，一般禽畜圈舍及附属设施根据建造成本价并结合成新来评估。人住的房屋如职工宿舍、办公用房等，因为具有住房属性，则要结合周边的房屋价格进行评估。
不少地方也对禽畜圈舍的拆迁补偿有制定标准，比如说山东省潍坊市公布的2017年禽畜舍补偿标准为砖混或砖木结构250-350一平，简易结构70-200一平，当然，一些规模化养殖场的禽畜圈舍建造较好，甚至建设有通风、保暖等设施，这个就应当进行评估，而不应当一刀切。
如果只是因环保关停，不拆除房屋和附属设施，则不涉及房屋和附属设施的补偿，但是也要警惕的是一些地方先以环保的名义把养殖场关停，然后再以养殖场的建筑物涉嫌违建来拆违，从而规避拆迁补偿的行为。
2、养殖场停产停业损失
一般来说，规模养殖场都是专业化养殖，办理了养殖证，有一些甚至是企业经营，有办理营业执照，而拆迁带来的就是生产经营的中断甚至是终止，面对这种情况，拆迁方应当基于养殖户停产停业损失的补偿。
对于企业，尤其是经营状况良好的企业，停产停业损失是非常重要的补偿点，但是呢，很多很多企业主往往比较重视房屋、设备设施等“硬件赔偿”，对停产停业损失等弹性空间较大的“软性补偿”重视不够，往往带来较大的损失。
3、对存栏禽畜的出清的补偿
遇到拆迁，但是圈里生猪还没有长成、鸡还没有长大，卖不上钱，而如果因为拆迁必须要处理，那这个损失应当由拆迁方补偿给养殖户，这就是存栏禽畜的出清补偿。
存栏禽畜的出清补偿，一般是结合禽畜的种类、大小、市场价格来确定，如仔猪多少钱一头，母猪多少钱一头，种猪多少钱一头，有一头算一头，有一只算一只，清点树木，确定价格之后，算出补偿金额。
4、养殖场搬迁补偿
对于专业化经营的养殖场，拆迁往往不代表终止养殖，而是需要重新物色新的位置，重建养殖场继续养殖，这个时候，就会涉及到养殖场的社保、物品搬迁到新的场所，在搬迁过程中存在损耗的问题，这就需要对设备搬迁和搬迁的损失进行评估补偿。
5、奖励
现在很多地方拆迁，都喜欢设置各种奖励，把奖励弄的比补偿本身还要高，其目的就是为了刺激被拆迁人积极签约，尽早搬迁。但是被拆迁人在拆迁过程中，既要看到奖励的激励性，也要看到补偿本身的合理性。
因环境保护的原因关停或者搬迁养殖场，主要是执行“十三五”生态环境保护规划。很多地方，在禁养区养殖场拆迁过程中，实行查处式的惩罚性关停和搬迁，只管完成上级交来的任务，却对养殖户的利益不管不顾，这样做是违法的。
二、未经审批的违建养殖场，难以获得赔偿
如果该养殖场本身就存在违规占有土地、并违法兴办养殖场的行为，那么可以由城管部门直接对该违法建设进行拆除，另外还需要追究养殖场主的法律责任。
根据《土地管理法》第七十六条、《土地管理法实施条例》第四十二条规定，未经批准而非法占用土地的，由县级以上人民政府土地行政主管部门责令退还非法占用的土地，并限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处罚款；对非法占用土地单位的直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予行政处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。并处罚款的，罚款额为非法占用土地每平方米30元以下。超过批准的数量占用土地，多占的土地以非法占用土地论处。
所以在这种情况下是肯定不可以获得拆迁补偿的。
三、农村企业拆迁养殖种植属于违章建筑吗
不是。农用地上搭建养殖场是农户正常从事养殖的行为。养殖场场主取得了合法的承包经营权证，在土地上搭建涉农设施用于养殖的行为，属于从事农业生产经营活动的合法行为。农业用地，是指用于农业生产的土地，包括耕地、园地、林地、牧草地、畜禽饲养地、设施农业用地、农村道路、坑塘水面、其他农用地等。
养殖厂需要办理的手续如下：
1、需要办理生产设施用地的备案手续，签订用地协议在国土局和农业局备案；
2、需要配套建设污染防治设施。环评手续需到环保局办理；
3、排污许可证；
4、动物防疫条件合格证；
5、野生动物驯养繁殖许可证；
6、办理工商登记；
7、养殖户取得营业执照后，需要到畜牧局办理养殖场备案登记手续。
法律依据：《畜禽规模养殖污染防治条例》第九条
养殖厂的排污许可证如何办理
1、申请人在国家排污许可信息公开系统进行许可申请前信息公开；
3、符合要求的，出具申请受理通知书并在国家排污许可合法平台上进行网上申报；