一、人工清粪。即人工利用铁锨、铲板、扫帚等将粪便收集成堆，人力装车运至堆粪场或直接施入农田，是小规模牛场普遍采用的清粪方式。饲养员定期对舍内水泥地面上的牛粪进行人工清理，无需设备投资、简单灵活，但工人工作强度大、环境差，工作效率低。
二、半机械清粪。半机械清粪将铲车、拖拉机改装成清粪铲车，或者购买专用清粪车辆、小型装载机进行清粪。目前，铲车清粪工艺运用较多，是从全人工清粪到机械清粪的过渡方式。清粪铲车由小型装载机改装而成，推粪部分利用了废旧轮胎制成一个刮粪斗，更换方便，小巧灵活。饲养员开车把清粪通道中的粪刮到牛舍一边后集中运走。
三、刮粪板清粪。新建的规模牛场主要使用刮粪板清粪，该系统主要由刮粪板和动力装置组成。清粪时，动力装置通过链条带动刮粪板沿着牛床地面前行，刮粪板将地面牛粪推至集粪沟中或牛舍一边。这种设备投资不高，当牛舍长度在100米至120米和200米至240米时，设备的利用效率最高，设备的耗电量不超过18度/天，仅需对转角轮进行润滑维护(间隔2周至3周)。此清粪方式能随时清粪，机械操作简便，工作安全可靠，刮板高度及运行速度适中，基本没有噪音，对牛群的行走、饲喂、休息不造成任何影响。刮粪板不需要专门的安装基础，无论是新建的还是旧牛舍，设备的安装都非常方便，可称为最适合牛场的“低碳”污粪处理系统。
四、堆肥发酵。清理的牛粪送至堆粪场经堆积发酵无害化处理后，即成为有机肥料，堆肥过程中形成高温，能杀死各种病菌和虫卵，粪污中的多种成分能转变成植物生长需要的有效养分，可直接施于设施农业栽培或农作物种植。堆肥处理具有运行费用低、处理量大、无二次污染等优点而被广泛使用，具体作法是在堆粪场铺一层厚10厘米至15厘米的细草，以吸收下渗液体，然后将牛粪堆积成条垛状，表面用稀泥封好，1个月后翻堆一次，重新堆好，再用泥土封严，达到完全腐熟夏季约需2个月，冬季则需3至4个月。通过堆肥发酵处理生产有机肥，将养殖粪便变废为宝，改善土壤团粒结构，提高农作物产量和品质，为生产绿色有机农产品发挥显著作用，促进生态良性循环
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