刘汉元介绍，根据现行《企业所得税法实施条例》，在养殖环节，畜禽养殖企业免缴企业所得税，水产养殖企业则要缴纳12.5%的企业所得税，该政策一方面导致两类企业利润差异巨大，另一方面导致大量水产养殖者为避免缴纳企业所得税，不愿进行公司化运作，更倾向于选择以个体户或合作社形式经营，制约了产业的规模化、集约化发展。
此外，农产品收购发票不能跨省使用，也阻碍了大宗水产品的流通。刘汉元称，目前向合作社、企业收购农产品，可以取得对方自行开具的普通发票，而向个人养殖户收购时，对方所在的税务局往往对代开普通发票有各种限制，且全国各地的要求也不一致。例如，有的地方规定水产养殖户需提供租塘合同，对于多次转手的合同，税务局不予代开普通发票；有的地方规定，如果个人养殖户名下有法人实体，也不得代开普通发票，而农产品收购发票又不允许跨省进行开具，甚至部分省、市、自治区不允许跨市（县）使用。
“而我国水产养殖主要集中在华南、华东和华中等水资源丰富地区，与畜禽养殖可就地消费、易于加工的特点不同，水产品存在大量的全国范围内流通。”刘汉元认为，按照目前税法规定，只能在本省使用农产品收购发票，导致公司化运作存在取票难和取票成本高的问题。
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